VNU-UET Repository: No conditions. Results ordered -Date Deposited. 2024-03-29T08:06:53ZEPrintshttp://eprints.uet.vnu.edu.vn/images/sitelogo.pnghttps://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/2022-08-19T05:35:51Z2022-08-19T05:35:51Zhttp://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/4731This item is in the repository with the URL: http://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/47312022-08-19T05:35:51ZSWEET Gene Family in Sugar Beet (Beta vulgaris): Genome-Wide
Survey, Phylogeny and Expression AnalysisBackground and Objective: The SWEET (Sugars Will Eventually be Exported Transporter) proteins play important roles in modulating
the growth and development processes in plants. However, little information is available on the SWEET family in sugar beet
(Beta vulgaris). The objectives of this present study were to genome-wide identify and characterize the BvSWEET family in sugar beet.
Materials and Methods: Based on the available genome, proteome and transcriptome databases of sugar beet, various computational
tools have been used to analyze the nucleotide and full-length protein sequences of members of the BvSWEET family. Results: A total
of 16 members of the BvSWEET family has been identified in sugar beet at the genome-wide scale. Structural analysis indicated that the
BvSWEET family exhibited variable characteristics. Furthermore, the BvSWEET family in sugar beet could be categorized into four distinct
groups like in other plant species. Of our interest, we found that some BvSWEET genes exhibited strongly preferential expression in major
organs/tissues under adverse environmental stimuli. Conclusion: The results provided a comprehensive foundation for further functional
characterization of the BvSWEET gene family.Viet Hong Lalaviethong.sp2@gmail.comDuc Ha Chucd.ha@vnu.edu.vnThi Quyen Haquyenht@vnu.edu.vnThi Thanh Huyen TranVan Hai TongVan Tien TranThi Ngoc Quynh LeThi Thu Huong BuiPhi Bang Cao2022-08-19T05:35:25Z2022-08-19T05:35:25Zhttp://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/4771This item is in the repository with the URL: http://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/47712022-08-19T05:35:25ZỨng dụng từ trường trong thúc đẩy sinh trưởng, phát triển và sinh khối của cây trồngThực vật luôn tồn tại và sinh sôi trong điều kiện từ trường (magnetic field, MF) trái đất. Tuy nhiên, cơ chế tác động của từ trường đến thực vật đến nay vẫn chưa được làm sáng tỏ. Bài báo trình bày một cách chi tiết về tác động của từ trường đến sinh trưởng, phát triển và sinh khối của cây trồng. Trong đó, xử lý MF được chứng minh có thể tăng cường hoạt tính của các enzyme phân giải giúp tăng tỷ lệ nảy mầm ở hạt. Xử lý MF cũng giúp kích thích tổng hợp sắc tố ở lá, tăng hiệu quả của quang hợp và hô hấp giúp cây sinh trưởng và phát triển tốt hơn, đồng thời cải thiện được khả năng chống chịu các điều kiện ngoại cảnh bất thuận. Mặc dù vậy, xử lý MF vẫn đặt ra một số câu hỏi liên quan đến độc tính và những tác động môi trường. Tóm lại, bài báo này đã cung cấp một cái nhìn toàn diện về một giải pháp mới trong nghiên cứu sản xuất nông nghiệp bền vững và thân thiện với môi trường.Duc Ha Chucd.ha@vnu.edu.vnViet Hong Lalaviethong.sp2@gmail.comThi Quyen Haquyenht@vnu.edu.vnK.L. Nguyennl.khanh@vnu.edu.vnChau Thuy PhamDang Khoa Trankhoatd@vnu.edu.vnDang Co Nguyencond@vnu.edu.vnDinh Tu BuiHuy Hàm Lêlhham@agi.ac.vn2022-06-21T10:21:31Z2022-06-21T10:21:31Zhttp://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/4738This item is in the repository with the URL: http://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/47382022-06-21T10:21:31ZỨng dụng từ trường trong thúc đẩy sinh trưởng, phát triển và sinh khối của cây trồngHuu Kien NguyenDuc Ha Chucd.ha@vnu.edu.vnViet Hong Lalaviethong.sp2@gmail.comThi Quyen Haquyenht@vnu.edu.vnLe Khanh NguyenChau Thuy PhamDang Khoa Trankhoatd@vnu.edu.vnDang Co Nguyencond@vnu.edu.vnDinh Tu Buibuidinhtu@vnu.edu.vnHuy Hàm Lêlhham@agi.ac.vn2022-03-21T00:44:18Z2022-03-21T00:44:18Zhttp://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/4709This item is in the repository with the URL: http://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/47092022-03-21T00:44:18ZInvestigation on sweet orange farming practices and establishment of the watering model
combined with fertilizing for development of sweet orange in Hung YenSustainable orange farming is considered as one of the important agricultural development strategies of Hung Yen
province. In this study, the farming practices of sweet oranges in Hung Yen have been comprehensively investigated.
Our results revealed that the surface water or surface combined with groundwater was mostly used as the major
irrigation method in the cultivation of sweet oranges, causing water loss, root erosion and fertilizer washout. Based
on the investigation of farming practices, an improved irrigation approach was proposed by using a droplet irrigation
system around the root combined with the automated fertilizing model in the orange growing area of Hung Yen.
Particularly, this system was initially demonstrated to be water- and fertilizer-save, maintain the soil humidity,
prevent the soil and fertilizer erosions and reduce the labor costs.Thi Quyen Haquyenht@vnu.edu.vnThi Kim Thu DuongThi Na HoangVan Lam TranDuc Ha Chucd.ha@vnu.edu.vnGia Vuong Nguyen2022-03-21T00:29:57Z2022-03-21T00:29:57Zhttp://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/4707This item is in the repository with the URL: http://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/47072022-03-21T00:29:57ZRecent Advances and Future Perspectives for the Improvement
of Stress Tolerance in Rice Breeding Using CRISPR/Cas9Rice (Oryza sativa L.) is one of the most important staple crops that is widely cultivated in the world. Due to the
critical role of rice in the global food security, great efforts have been made in order to develop new rice varieties with
good agronomic traits, such as biotic and abiotic stress tolerance. The CRISPR/Cas9 has emerged as a promising
system for the improvement of various traits of crop plants because of its efficiency, simplicity, and versatility. In this
mini review, we discussed the applications of the CRISPR/Cas9 gene editing system to improve a wide range of traits
in rice varieties adapted to unfavorable conditions. Specifically, a number of functional and regulatory genes that are
associated with diseases (rice blast, bacterial blight) and pesticide resistance and abiotic stress (salinity, drought, and
cold) tolerance have been functionally characterized via the mutants produced by the CRISPR/Cas9 system.
Additionally, the advances and limitations of using CRISPR/Cas9 system in rice plants were discussed. Taken
together, our paper could provide a solid foundation for further application of genome editing tools in plant breeding
for tackling climate change.Thi Thu Huong BuiThi Hong NguyenDuc Ha Chucd.ha@vnu.edu.vnThi Quyen Haquyenht@vnu.edu.vnPhuong Thu PhamThi Thu Huong PhungThi Ngoc Quynh LeQuoc Trung NguyenHuy Gioi DongThanh Hai NguyenThi Thao Ninh2021-12-13T03:53:13Z2021-12-13T03:53:13Zhttp://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/4657This item is in the repository with the URL: http://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/46572021-12-13T03:53:13ZGENOME-WIDE IDENTIFICATION AND COMPUTATIONAL
CHARACTERIZATION OF THE NUCLEAR FACTOR-YC SUB-UNITS
IN GRAIN AMARANTH (Amaranthus hypochondriacus)Nuclear factor-Y (NF-Y) has been known as one of the plant-specific
transcription factors that play key roles in numerous biological processes during
the growth and development of plant species. In this study, a comprehensive
analysis of NF-YC sub-units in grain amaranth (Amaranthus hypochondriacus)
was carried out based on the bioinformatics approaches. Firstly, a total of five
members of the NF-YC sub-units was reported in the grain amaranth. Its structural
analyses revealed that the NF-YC sub-units were variable in physic-chemical
properties, like protein sizes, molecular masses, isoelectric point, instability index,
and grand average of hydropathy. Of our interest, the expression profiles of genes
encoding NF-YC sub-units in various tissues/organs during the growth and
development of grain amaranth. We found that three genes, including AhNF-YC01,
AhNF-YC04, and AhNF-YC05 were highly expressed in leaf, root, floral, immature
seed, and stem tissues. Interestingly, AhNF-YC05 was exclusively expressed in leaf
and stem tissues. Taken together, our study could provide a solid understanding for
further functional characterization of genes encoding NF-YC sub-units in grain
amaranth.Thi Thanh Huyen TranViet Hong Lalaviethong.sp2@gmail.comThi Ngoc Quynh LeChau Thuy PhamThi Quyen Haquyenht@vnu.edu.vnDuc Ha Chucd.ha@vnu.edu.vn2021-11-27T02:32:51Z2021-11-27T02:32:51Zhttp://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/4653This item is in the repository with the URL: http://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/46532021-11-27T02:32:51ZNGHIÊN CỨU ĐẶC TÍNH LÝ HÓA VÀ XÂY DỰNG MÔ HÌNH CẤU TRÚC KHÔNG GIAN CỦA NHÓM NHÂN TỐ PHIÊN MÃ YẾU TỐ NHÂN Y Ở GIỐNG CHÓ DINGO (Canis familiaris dingo)Yếu tố nhân Y (NF-Y) là một trong những nhóm protein điều hòa đóng vai trò nhân tố trung tâm trong các cơ chế điều hòa hoạt động của gen ở các loài trong sinh giới. Trong nghiên cứu này, thông tin về họ NF-Y ở giống chó Dingo (Canis familiaris dingo), bao gồm chú giải, đặc điểm lý hóa, cấu trúc gen, vùng domain đặc trưng, cấu trúc không gian, cấu trúc ARN, đã được tìm hiểu thông qua công cụ tin sinh học. Tiểu phần NF�YA gồm 347 axít amin và có trọng lượng phân tử 36,88 kDa, trong khi hai tiểu phần NF-YB và NF-YC có kích thước và trọng lượng phân tử lần lượt là 207 axít amin, 22,81 kDa và 402 axít amin, 44,69 kDa. Các tiểu phần không ổn định trong điều kiện ống nghiệm và có tính ưa nước, tương tự như ở các loài sinh vật khác. Phân tích cấu trúc cho thấy gen mã hóa NF-YA, NF-YB và NF-YC ở giống chó Dingo gồm 9, 6 và 10 exon. Kết quả của nghiên cứu này đã cung cấp những hiểu biết cơ bản về nhóm NF-Y ở giống chó Dingo.Duc Ha Chucd.ha@vnu.edu.vnThi Nho NguyenHuu Duc NguyenQuôc Trung NguyễnThi Phuong Lien TranThi Ngoc Quynh LeThi Quyen Haquyenht@vnu.edu.vn2021-11-27T02:27:31Z2021-11-27T02:27:31Zhttp://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/4640This item is in the repository with the URL: http://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/46402021-11-27T02:27:31ZẢNH HƯỞNG CỦA TỪ TRƯỜNG BỔ SUNG ĐẾN TỶ LỆ NẢY MẦM
VÀ SINH TRƯỞNG GIAI ĐOẠN SỚM CỦA CÂY HOA ĐỒNG TIỀN LÙN
NUÔI CẤY MÔTừ trường (MF) được chứng minh là một trong những yếu tố có tác động tích cực đến sự sinh trưởng, phát triển
và n ng suất của cây trồng. Tuy nhiên, những ứng dụng của MF đến các đối tượng cây trồng vẫn còn hạn chế.
Trong nghiên cứu này, ảnh hưởng của MF t nh đến cây hoa đồng tiền l n (Gerbera spp.) nuôi cấy mô đã được
tìm hiểu. Kết quả bước đầu cho thấy, MF ở cường độ 150 mT có ảnh hưởng tích cực đến khả n ng tỷ lệ nảy
mầm và khả n ng phát triển của rễ ở cây nuôi cấy mô. Trong đó, đ t nam châm cực Bắc hướng trên được ghi
nhận là tối ưu, tỷ lệ nảy mầm của hạt sau 15 và 30 ngày lần lượt đạt từ 93,33 và 100%, vượt trội so với đô i
chứng không xử l MF. Bên cạnh đó, chiều dài rễ ở giai đoạn nảy mầm và cây non c ng được ghi nhận chịu sự
tác động của MF. áng ch , xử l MF đã kích thích sự phát triển của rễ ở cây nuôi cấy mô 30 ngày tuổi. Cụ
thể, tỷ lệ ra rễ, chiều dài rễ và số rễ/cây ở công thức đ t nam châm cực Bắc hướng trên đạt 46,67%, 10,00 mm và
1,67 rễ/cây. Tuy nhiên, nghiên cứu không ghi nhận ảnh hưởng rõ ràng của MF đến sự phát triển của chồi và lá
trong giai đoạn nuôi cấy mô. Tóm lại, kết quả nghiên cứu này đã cung cấp những bằng chứng quan tr ng gi p
chứng minh tiềm n ng ứng dụng của MF trong kích thích sự hình thành và phát triển của rễ của cây nuôi cấy mô.Viet Hong Lalaviethong.sp2@gmail.comXuan Phong OngDuc Ha Chucd.ha@vnu.edu.vnThi Quyen Haquyenht@vnu.edu.vnHuy Ham Le2021-11-27T02:27:11Z2021-11-27T02:27:11Zhttp://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/4638This item is in the repository with the URL: http://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/46382021-11-27T02:27:11ZPHÂN TÍCH ĐẶC ĐIỂM CỦA CÁC GENE CẢM ỨNG TÍN HIỆU AUXIN ĐÁP ỨNG
MẠNH VỚI ĐIỀU KIỆN HẠN VÀ NÓNG Ở CÀ CHUA (Solanum lycopersicum)Ở thực vật, đáp ứng bất lợi thông qua tín hiệu auxin vẫn chưa thực sự được làm sáng tỏ. Trong nghiên cứu này,
tập hợp những gene t ng cường biểu hiện mạnh trong điều kiện hạn và nóng và cảm ứng với auxin đã được phân
tích trên đối tượng cây cà chua (Solanum lycopersicum) bằng các công cụ tin sinh h c. Kết quả đã xác định được
tổng số 10 gene cảm ứng auxin (|fold-change 2) có đáp ứng mạnh với điều kiện xử l hạn và nóng (fold�change 10). Ch giải chức n ng bằng công cụ Blast2GO và Pfam đã cho thấy các gene ứng viên mã hóa một số
nhóm nhân tố phiên mã liên quan đến đáp ứng bất lợi ở thực vật, điển hình như Heat shock protein và bZIP. Tiếp
theo, các phân tử protein này có đ c điểm l hóa đ c trưng tương đối đa dạng. Cụ thể, kích thước của 10 protein
dao động từ 152 (16,92 kDa) đến 972 aa (108,58 kDa), với giá trị điểm đẳng điện từ khoảng acid đến base. Phần
lớn các phân tử có tính ưa nước và ổn định trong điều kiện ống nghiệm. Thông qua công cụ TargetP,
Solyc01g095320 và Solyc01g109880 được xác định ở ty thể và lục lạp. Kết quả nghiên cứu này đã cung cấp
những dẫn liệu khoa h c quan tr ng gi p tìm hiểu rõ hơn về đáp ứng hạn và nóng thông qua con đường tín hiệu
auxin ở thực vật.Van Hai TongQuoc Trung NguyenViet Bach CaoThi Ngoc Quynh LeViet Hong Lalaviethong.sp2@gmail.comThi Quyen Haquyenht@vnu.edu.vnMinh Trien Phamtrienpm@vnu.edu.vnDuc Ha Chucd.ha@vnu.edu.vn2021-11-27T02:26:40Z2021-11-27T02:26:40Zhttp://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/4637This item is in the repository with the URL: http://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/46372021-11-27T02:26:40ZPHÂN TÍCH CẤU TRÖC VÀ BIỂU HIỆN CỦA HỌ GENE MÃ HÓA NHÂN TỐ
PHIÊN MÃ NAC Ở CÂY LẠC (Arachis hypogaea) BẰNG CÔNG CỤ TIN SINH HỌCNhân tố phiên mã NAC là một trong những nhóm protein điều hòa đóng vai trò quan tr ng liên quan đến các quá
trình sinh l ở cây trồng. Tuy nhiên, chưa có ghi nhận nào về nhóm NAC trên đối tượng cây lạc (Arachis
hypogaea), một trong những cây h đậu quan tr ng hàng đầu hiện nay. Trong nghiên cứu này, thông tin cơ bản
về h AhNAC, bao gồm mã định danh, ch giải, đ c tính protein, phân nhóm và cấu tr c gene, đã được tìm hiểu
thông qua các công cụ tin sinh h c. Kết quả đã xác định được tổng số 29 thành viên của h AhNAC ở lạc. Trong
đó, các AhNAC có kích thước và tr ng lượng phân tử dao động từ 150 đến 697 amino acids và từ 26,04 đến
37,92 kDa, trong khi tất cả các AhNAC đều có tính ưa nước. Cấu tr c v ng bảo thủ của AhNAC gồm 5 v ng đ c
trưng, điển hình cho NAC ở thực vật. Tiếp theo, dựa theo sơ đồ hình cây Neighbor-Joining đã chỉ ra rằng, h
AhNAC có thể được chia làm 2 nhóm lớn, tương tự như ghi nhận ở h NAC trên các loài thực vật khác. Bên
cạnh đó, phân tích cấu tr c cho thấy các gene AhNAC có số lượng intron dao động từ 1 đến 6, trong khi đa số các
gene AhNAC chỉ chứa 2 intron. Kết quả của nghiên cứu này đã cung cấp những dẫn liệu cơ bản đầu tiên về h
AhNAC nhằm định hướng cho các nghiên cứu tiếp theo về mức độ biểu hiện của gene AhNAC trên cây lạc.Duc Ha Chucd.ha@vnu.edu.vnThi Linh PhamThanh Hao NguyenQuoc Trung NguyenViet Hong Lalaviethong.sp2@gmail.comThi Ngoc Quynh LeThi Quyen Haquyenht@vnu.edu.vnMinh Trien Phamtrienpm@vnu.edu.vn2020-12-16T01:43:30Z2020-12-16T01:43:30Zhttp://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/3632This item is in the repository with the URL: http://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/36322020-12-16T01:43:30ZNghiên cứu vi nấm nội sinh cây Thạch tùng răng cưa (Huperzia serrata) có khả năng sinh tổng hợp enzyme β-galactosidaseEnzyme β-galactosidase được khai thác ứng dụng trong các lĩnh vực khác nhau như y tế, công
nghiệp chế biến thực phẩm, công nghệ sinh học. Trong nghiên cứu này, 45 chủng vi nấm nội
sinh phân lập từ cây thảo dược Thạch tùng răng cưa phân bố tại Việt Nam được sàng lọc khả
năng sinh tổng hợp enzyme β-galactosidase. Kết quả tuyển chọn được 2 chủng có khả năng tổng
hợp β-galactosidase, trong đó chủng TĐL28.1 có hoạt tính enzyme đạt 1,92 IU/ml cao hơn
chủng TĐL5v (0,36 IU/ml). Hai chủng đã được dịnh danh là Aspergillus niger TĐL28.1 và
Fungal sp. Tsp5v.Thị Minh Thành LêThị Hồng Anh HoàngThi Quyen Haquyenht@vnu.edu.vnThị Tuyên Đỗ2020-12-14T07:27:55Z2020-12-14T07:27:55Zhttp://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/3282This item is in the repository with the URL: http://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/32822020-12-14T07:27:55ZAnalysis of gene encoding haemolysin A of Vibrio cholerae isolated in VietnamVibrio cholerae is the cholera causing agent, divided into two biotypes, including the classical biotype and ElTor biotype. Both of these biotypes caused cholera epidemics in the world. The classical biotype caused 6th cholera pandemic (from 1921 to 1961), and ElTor biotype caused 7th cholera pandemic (from 1961 to the 70s). Haemolysin A, a hemolytic protein of V. cholerae ElTor biotype, is encoded by the hlyA gene. This gene is often used for analyzing genetic relationship between strains in the same species or between species in the same Vibrio genus. Results of analyzing nucleotide and amino acid sequences of hlyA gene of V. cholerae strain causing cholera in Vietnam (named hlyA.VN) showed that: the hlyA.VN gene sequence was similar to the hlyA gene sequences of V. cholerae strains of the 6thand 7thcholera epidemics. The hlyA gene of the 6th cholera epidemic strain was deficient in 11 nuleotides (this deficiency leading to the loss of 4 amino acids in the haemolysin A protein) comparing to hlyA.VN gene and hlyA gene of the 7th cholera epidemic strain. The results of genetic distance analysis as well as phylogenetic tree construction also confirmed V. cholerae causing cholera in Vietnam was closely relationship to the strains causing cholera pandemics in the world. It is great significance for the surveillance of molecular epidemiology to prevent cholera effectively.Thi Quyen Haquyenht@vnu.edu.vn2020-12-04T08:30:01Z2020-12-04T08:30:01Zhttp://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/4127This item is in the repository with the URL: http://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/41272020-12-04T08:30:01ZUsing cassava waste of the cassava starch processing as food for raising African Nightcrawler (Eudrilus eugeniae) to obtain vermicomposting and earthworm biomassThe raising earthworms by cassava waste is a useful solution to reduce environmental pollution caused by cassava starch
processing. In this study, cassava waste (including cassava peel, cassava pieces and soil) was used as a food source for
raising African Nightcrawler (Eudrilus eugeniae) with experiments as follows: Experiment 1: earthworms were raised in
crushed cassava waste right after being discharged; Experiment 2: earthworms raised in crushed cassava waste that had
been incubated with organic matter decomposing microbiological preparation for the previous two weeks; Experiment 3:
earthworms were raised in crushed cassava waste that had self-decomposed naturally for the previous two weeks. The
cassava waste was decomposed naturally for 4 weeks for the control. Besides, the crushed cassava waste was also
incubated by organic matter decomposing microbiological preparation for 4 weeks for getting more data for comparison
between experiments (Experiments 4). The experiments were followed for 4 weeks. The results showed that the content of
organic matter, humic acid and total nitrogen in organic cassava humus obtaining from experiments increased comparing
to the control: total organic matter content reached from 10.4%-15.7%, higher than the control (8.2%) from 1.27-1.92
times, humic acid content reached 0.6 - 0.8% and total nitrogen reached 0.3%. In which, the experiment 3 had the highest
quality of humus (organic matter content 15.7%, total nitrogen 0.3%, humic acid 0.7% and fulvic acid 0.5%). The
experiment 3 also had the highest earthworm biomass (3.6kg), increasing 30.5% comparing to experiment 1 and 19.4%
comparing to experiment 2. Therefore, experiment 3 was proposed for application in treatment of cassava waste in larger
scale. The organic humus obtaining from raising earthworms by cassava waste can be used as raw materials for producing
vermicompost. The earthworm biomass can be used as protein rich food for domestic animals (such as chicken, tortoise,
eel, fish...) or used as nutritious fertilizer.Thi Quyen Haquyenht@vnu.edu.vnThi Minh Thanh Leminhthanh.ibt@gmail.com2020-12-04T08:29:45Z2020-12-04T08:29:45Zhttp://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/4126This item is in the repository with the URL: http://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/41262020-12-04T08:29:45ZSelection of nitrogen fixation and phosphate solubilizing
bacteria from cultivating soil samples of Hung Yen province
in VietnamThe nitrogen fixing bacteria (NFB) and phosphate solubilizing bacteria (PSB) are used widely for producing of
microbiological fertilizers. This study aims to seek nitrogen-fixing and phosphate-solubilizing bacteria strains to add to
the collection of candidate strains for producing single and multi-function microbiological fertilizers. From 40 soil
samples of 8 fields for cultivating rice, medicinal plants and vegetables, 15 NFB strains and 12 PSB strains were
isolated and determined the ability of fixing nitrogen and solubilizing inorganic phosphate compound through creation
of NH4+ and PO4- in culture medium. Among 15 NFB strains, the fixing nitrogen activities of 7 strains were much higher
than the remaining strains, including NFBR3, NFBV2, NFBM5, NFBM3, NFBM1, NFBV5 and NFBR2 with NH4+
concentration 18.85 mg/l, 18.41 mg/l, 17.32 mg/l, 16.19 mg/l, 15.49 mg/l, 12.83 mg/l and 12.57 mg/l, respectively
Among 12 PSB strains, The ability of solubilizing phosphate of 5 strains were higher than the others, including PSBM2,
PSBR1, PSBV1, PSBR5 and PSBR3 with PO4- concentration 14.49 mg/l, 11.83 mg/l, 11.33 mg/l, 10.65 mg/l, 10.37 mg/l,
respectively.. 3 NFB strains (NFBR3, NFBV2, NFBM5) and 3 PSB strains (PSBM2, PSBR1, PSBV1) with higher activity were
identified by 16S-rDNA sequence analysis and comparing to some homologous sequences in genbank. The results
showed that NFBR3 was identified as Azotobacter vinelandii, NFBV2 as Azopirillum brasilense, NFBM5 as Azotobacter
chroococum, PSBM2 and PSBV1 as Pseudomonas fluorescens and PSBR1 as Bacillus subtilis.Thi Quyen Haquyenht@vnu.edu.vnThi Thu Ha Chuhachuthi@yahoo.com2020-12-04T08:28:24Z2020-12-04T08:28:24Zhttp://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/4124This item is in the repository with the URL: http://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/41242020-12-04T08:28:24ZĐIỀU TRA VI SINH VẬT TRONG ĐẤT NÔNG NGHIỆP VÀ NƯỚC TƯỚI
Ở MỘT SỐ XÃ THUỘC TỈNH HƯNG YÊNVi sinh vật trong đất là một trong các dấu hiệu để đánh giá chất lượng đất nông nghiệp. 40 mẫu đất trồng các loại cây khác nhau được thu từ 8 ruộng và 20 mẫu nước tưới được thu từ 6 nguồn nước tại khu vực đồng ruộng của 4 xã thuộc huyện Khoái Châu và Yên Mỹ của tỉnh Hưng Yên được phân tích đánh giá sự đa dạng của một số nhóm vi sinh vật. Kết quả cho thấy số lượng vi sinh vật đạt giá trị cao nhất lần lượt trong các mẫu đất và nước như sau: vi sinh vật hiếu khí tổng số: 1x107 CFU/g và 2,7x106 CFU/ml; vi khuẩn cố định đạm sống tự do Azotobacter: 4,2x103 CFU/g và 4x101 CFU/g; vi khuẩn cố định đạm sống hội sinh Azospirillum: 2,5x102 CFU/g và 1,9x 101 CFU/ml; vi sinh vật phân giải phosphate: 4,2x105 CFU/g và 8,3x101 CFU/ml; vi khuẩn phân giải cellulose: 3,4x106 CFU/g và 7,8x102 CFU/ml, xạ khuẩn phân giải cellulose: 3,2x105 CFU/g và 6,7x101 CFU/ml, vi nấm phân giải cellulose: 2,4 x 104 CFU/g và 5,6 x 101 CFU/ml. Với mật độ vi sinh vật rất thấp cho thấy chất lượng đất trồng tại đây đang bị giảm sút. Vì vậy cần hạn chế sử dụng phân bón và thuốc trừ sâu hóa học, đồng thời chú trọng đến biện pháp canh tác hữu cơ nhằm gia tăng quần thể vi sinh vật tự nhiên có lợi trong đất, từ đó cải thiện chất lượng đất trồng.Thi Quyen Haquyenht@vnu.edu.vnThi Thu Ha Chuhachuthi@yahoo.comThi Minh Thanh Leminhthanh.ibt@gmail.com2019-11-29T05:23:05Z2020-12-14T07:29:12Zhttp://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/3630This item is in the repository with the URL: http://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/36302019-11-29T05:23:05ZNghiên cứu khả năng sinh hoạt tính kháng khuẩn của vi nấm nội sinh cây Thạch tùng răng cưa (Huperzia serrata) phân bố tại Lâm Đồng - Việt NamVi khuẩn kháng kháng sinh đang là mối quan tâm trên toàn cầu. Việt Nam là một trongcác nước có tỷ lệ kháng thuốc kháng sinh cao trên thế giới. Hướng tới việc tìm kiếm các hoạt chất, kháng sinh mới có nguồn gốc từ vi sinh vật nội sinh cây thảo dược, 45 chủng vi nấm nội sinh phân lập từ cây thảo dược Thạch tùng răng cưa phân bố tại lâm Đồng-Việt Nam được sàng lọc hoạt tính kháng 3 loại vi khuẩn kiểm định Escheria coli, Moraxella cataharrlis, Staphylococus aureus và nấm men Candida albicans. Hai mươi chín chủng nấm nội sinh có hoạt tính kháng khuẩn từ 1-4 loài vi sinh vật kiểm định được khảo sát, trong đó có 5 chủng cho khả năng ức chế cao đồng thời cả 4 lòai vi sinh vật kiểm định với đường kính vòng kháng khuẩn từ 16-36 mm. Bằng phương pháp định danh truyền thống và sinh học phân tử, 5 chủng vi nấm đã dược định danh là Trichoderma sp. TĐL1, Fusarium sp. TĐL1, Fungal endophyte sp. RĐL4, TĐL51 và LĐL15.Thi Minh Thanh Leminhthanh.ibt@gmail.comThi Hong Anh NguyenVan Quyen DongThi Quyen Haquyenht@vnu.edu.vn2018-12-14T10:07:41Z2018-12-14T10:07:41Zhttp://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/3283This item is in the repository with the URL: http://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/32832018-12-14T10:07:41ZPHÂN TÍCH TRÌNH TỰ GEN MÃ HÓA ĐỘC TỐ TẢ
CỦA MỘT SỐ CHỦNG VIBRIO CHOLERAEVibrio cholerae, the major agent causing cholera, contains more than 200 serotypes based on O antigen. But only two serotypes of O1 and O139 have caused cholera pandemics in the global. The previous studies have shown that cholera toxin gene have been presented not only in epidemic strains, but also presented in strains of non-O1 / non-O139 serotypes. Opposite, V. cholerae O1 and O139 strains could also have no toxin gene.
In this papers, we selected the sequences of cholera toxin genes (ctx) from some of V. cholerae isolates representing the O1 serotype (the sixth and the seventh cholera pandemic strains) and non-O1 / non-O139 serotypes (strains of O27, O37 and O105 serotypes), that were isolated in different geographical regions of Asia for analyzing and comparison to cholera toxin gene of V. cholerae strain in Vietnam. By using MEGA version 6.0 software, the statistical data as well as the phylogenetic trees showed that cholera toxin gene of V. cholerae in Vietnam was different and always form a separate branch comparing to the cholera toxin genes of other strains. This proved that ctx gene of V.cholerae in Vietnam has own genetic characteristics comparing to ctx genes of the strains in other geographic zones.
The results have demonstrated it’s necessary of determining the changes of cholera toxin gene of V.cholerae strains in different geographical areas. This not only provides information for epidemiological surveillance but also provides important data for cholera disease prevention, because of differences in cholera toxin genes can lead to the ability of different anti-cholera toxin immune response during infecting by these pathogenic clones.Thi Quyen Haquyenht@vnu.edu.vn2018-07-06T03:25:55Z2018-07-06T03:25:55Zhttp://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/3037This item is in the repository with the URL: http://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/30372018-07-06T03:25:55ZAnalysis of gene encoding haemolysin A of Vibrio cholerae isolated in VietnamVibrio cholerae is the cholera causing agent, divided into two biotypes, including the classical biotype and ElTor biotype. Both of these biotypes caused cholera epidemics in the world. The classical biotype caused 6th cholera pandemic (from 1921 to 1961), and ElTor biotype caused 7th cholera pandemic (from 1961 to the 70s). Haemolysin A, a hemolytic protein of V. cholerae ElTor biotype, is encoded by the hlyA gene. This gene is often used for analyzing genetic relationship between strains in the same species or between species in the same Vibrio genus. Results of analyzing nucleotide and amino acid sequences of hlyA gene of V. cholerae strain causing cholera in Vietnam (named hlyA.VN) showed that: the hlyA.VN gene sequence was similar to the hlyA gene sequences of V. cholerae strains of the 6thand 7thcholera epidemics. The hlyA gene of the 6th cholera epidemic strain was deficient in 11 nuleotides (this deficiency leading to the loss of 4 amino acids in the haemolysin A protein) comparing to hlyA.VN gene and hlyA gene of the 7th cholera epidemic strain. The results of genetic distance analysis as well as phylogenetic tree construction also confirmed V. cholerae causing cholera in Vietnam was closely relationship to the strains causing cholera pandemics in the world. It is great significance for the surveillance of molecular epidemiology to prevent cholera effectively.Thi Quyen Haquyenht@vnu.edu.vn2018-07-06T03:25:16Z2018-07-06T03:25:16Zhttp://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/3036This item is in the repository with the URL: http://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/30362018-07-06T03:25:16ZNGHIÊN CỨU GEN CÓ VAI TRÒ CHẨN ĐOÁN VI KHUẨN SALMONELLA TYPHIMURIUMResearch and detection of genes having function for diagnose pathogenic bacteria are essential for environmental and safe food surveillance. In this study, we designed specific primers and constructed a thermal cycle to amplify the specific fragment of the invA gene that encodes the protein invasion of Salmonella typhimurium, having function for infection to the host. In addition, the bacterial clones containing invA gene has been cloned. The exact determination of the invA gene in this report was confirmed by nucleotide sequencing and compared to homology sequences in Genbank. The results of this study could be used to develop a Salmonella Diagnostic Kit using PCR. And the clones containing the invA gene would be stored to provide target genes for continuing studies.Thi Quyen Haquyenht@vnu.edu.vnThi Minh Tu Hoahoaminhtu@gmail.com2018-01-11T09:29:47Z2018-01-11T09:29:47Zhttp://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/2675This item is in the repository with the URL: http://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/26752018-01-11T09:29:47ZSTUDY ON GENE FOR DIAGNOSIS OF SALMONELLA TYPHIMURIUMResearch and detection of genes having function for diagnose pathogenic bacteria are essential for environmental and safe food surveillance. In this study, we designed specific primers and constructed a thermal cycle to amplify the specific fragment of the invA gene that encodes the protein invasion of Salmonella typhimurium, having function for infection to the host. In addition, the bacterial clones containing invA gene has been cloned. The exact determination of the invA gene in this report was confirmed by nucleotide sequencing and compared to homology sequences in Genbank. The results of this study could be used to develop a Salmonella Diagnostic Kit using PCR. And the clones containing the invA gene would be stored to provide target genes for continuing studies.Thi Quyen Haquyenht@vnu.edu.vnThi Minh Tu Hoahoaminhtu@gmail.com2016-12-14T08:29:23Z2016-12-14T08:29:23Zhttp://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/2027This item is in the repository with the URL: http://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/20272016-12-14T08:29:23ZSelection of lactic acid bacteria producing bacteriocinIn this work, lactic acid bacteria were isolated from 10 samples of the traditionally fermented foods (5 samples of Vietnamese fermented pork roll and 5 samples of the salted field cabbage) and 5 samples of fresh cow milks. These samples were collected from households in Vietnam. 22 strains of lactic acid bacteria were isolated for inhibition to Lactobacillus plantarum JCM 1149. Of these, only 2 strains including DC1.8 and NC1.2 have rod shape, the others have coccus shape. There were 7 strains showing higher antibacterial activity and selected forchecking spectrum of antibacteria with indicator bacteria consistting of Bacillus subtilis ATCC 6633, Enterococcus faecium JCM 5804 and Staphylococcus aureus TLU. . . By which, 3 strains including NC3.5 (from Vietnamese fermented pork roll), DC1.8 (from salted field cabbage) and MC3.19 (from fresh cow milk) were selected because of their higher antibacterial ability. However, the antibacterial activity of the lactic acid bacteria can be based on disposable compounds of them and some other antibacterial compounds produced during of their growth (such as lactic acid, H2O2, bacteriocins, …). For seeking lactic acid bacteria with capability of producing bacteriocins, antibacterial compounds with protein nature, , 3 above strains were checked sensitive to proteases (including protease K, papain, α – chymotrypsin and trypsin). Because bacteriocins are proteinaceous antibacterial compounds, so their antibacterial activity will be reduced if proteases are added. The result showed DC1.8 and MC3.19 were capable of producing bacteriocin during culture process. These two strains were classified to species based on analysis chemical characterisitcs by standard API 50 CHL kit and phylogeny relationship by 16s rRNA sequences. DC1.8 was identified as Lactobacillus acidophilus and MC3.19 as Lactococcus lactis.Thi Quyen Haquyenht@vnu.edu.vnThi Minh Tu Hoahoaminhtu@gmail.com2016-07-15T09:44:40Z2016-07-15T09:45:29Zhttp://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/1823This item is in the repository with the URL: http://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/18232016-07-15T09:44:40ZĐiều tra sự nhiễm virus black queen cell gây bệnh thối mũ chúa trên các đàn ong mật tại Việt NamThi Thuy Duong BuiThi Quyen Haquyenht@vnu.edu.vnThi Thu HaThuy Linh MaiHong Thai PhamVan Quyen Dong2016-07-15T09:42:53Z2016-07-15T09:44:22Zhttp://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/1822This item is in the repository with the URL: http://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/18222016-07-15T09:42:53ZNghiên cứu phát hiện virus gây bệnh thối đen mũ chúa (black queen cell virus) trên ong mật ở một số tỉnh miền Bắc Việt Nam năm 2013Thi Quyen Haquyenht@vnu.edu.vnThi Thu HaThuy Duong BuiVan Quyen Dong2015-11-07T04:44:47Z2015-11-07T04:46:06Zhttp://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/1282This item is in the repository with the URL: http://eprints.uet.vnu.edu.vn/eprints/id/eprint/12822015-11-07T04:44:47ZThe Changes in Antigenic Components of Vibrio Cholerae Strains Isolated in VietnamToàn bộ tế bào của các chủng Vibrio cholerare typ huyết thanh Inaba và typ huyết thanh Ogawa (chủng I389 và O395) được sử dụng để gây miễn dịch trên thỏ thu kháng huyết thanh (KHT). Các KHT này được ký hiệu là KHTInaba và KHTOgawa được dùng để thực hiện phản ứng miễn dịch với các thành phần kháng nguyên của 25 chủng V. cholerae phân lập từ 5 tỉnh thành của Việt Nam và hai chủng chuẩn I389 và O395) bằng kỹ thuật Western-blot. Phân tích kết quả lai miễn dịch cho thấy, có tổng số 11 thành phần kháng nguyên (TPKN) có kích thước khoảng 79kDa, 62kDa, 52kDa, 45kDa, 42kDa, 38kDa, 35kDa, 31kDa, 26kDa, 23kDa và 20kDa. Có 6 TPKN chung giữa 25 chủng với kích thước 79kDa, 62kDa, 45kDa, 35kDa, 31kDa và 20kDa, trong đó các kháng nguyên 45kDa, 31kDa và 20kDa có kích thước trùng với kháng nguyên OmpS, Omp- 31kDa và TcpA -là những kháng nguyên quan trọng trong nghiên cứu phòng bệnh tả. Ngoài ra có 23/25 chủng có kháng nguyên 42kDa tương đương với protein OmpT- cũng là kháng nguyên quan trọng trong phòng bệnh; 5/25 chủng không có kháng nguyên 38kDa và 23kDa và 11/25 chủng không có kháng nguyên 26kDa. Các chủng 17-19 của Hà Nội và 22-25 của Hải Phòng xuất hiện các thành phấn kháng nguyên (TPKN) giống hoàn toàn với kháng nguyên của chủng chuẩn I389 thuộc typ huyết thanh Inaba. Các chủng 1AG, 5HN, 6HN, 8HN, 20HN và 21HN có TPKN giống cả chủng I389 và O395. Các chủng 2AG, 3AG, 4CM, 7HN, 9HN, 10HN, 11HP, 12AG, 13HP, 14HP, 15HN và 16QN lại thiếu hụt một vài TPKN so với chủng I389. Tuy nhiên, biến đổi kháng nguyên của chúng chỉ là sự thiếu hụt TPKN chứ không phải xuất hiện TPKN mới. Các kết quả nghiên cứu này có thể được xem là nền tảng ban đầu cho các nghiên cứu về miễn dịch và dự phòng bệnh tảThi Quyen Haquyenht@vnu.edu.vnDuy Khang Dinh